Коренное население Аджарии составляют аджарцы. Они, по свидетельствам археологических раскопок, живут на территории Аджарии со времен новокаменного века неолита и относятся к картам — одному из племен, из которых сложилась грузинская нация.
Сообщения об Аджарии встречаются в письменных источниках VII-VI вв. до н.э. Название Батуми, Батум часто упоминается в Византийских письменных источниках IV в. до н.э.
По мнению известного археолога Д. Бакрадзе, аджарцы издавна находились под влиянием той цивилизации, которая исходила из Древней Греции, имели свою культуру, аналогичную которой мы не можем наблюдать среди грузин, населяющих горные районы.
Во время существования легендарного Колхидского царства (VII-III вв. до н.э.) прибрежные города Аджарии — Пичвнари, Батуми, Апсарос (Гонио) и другие играли важную роль в политической и экономической жизни.
Согласно Д. Бакрадзе, территория Аджарии в III в. до н.э. простиралась от Самцхе до Черного моря, с юга граничила с Шавшети, на востоке граница проходила вдоль горы Бахмаро, с юго-запада доходила до села Сарпи, а в сторону северо-запада до р. Супса.
В древнейших исторических источниках Аджария часто упоминается как страна Аджария. Как четко выраженная административная единица Грузии Аджария существует с IV-III веков до н.э. Это подтверждается в трудах древнегрузинского историка Леонтия Мровели и описании жизни царя Парнаоза, жившего в III веке до н.э., во времена которого Аджария представляла одно из шести отдельных княжеств грузинского государства.
Аджарию традиционно делят на две части: приморскую и горную, которые вместе или по отдельности в разные периоды истории были в составе различных грузинских царств.
В V веке часть территории Аджарии попадает в состав Иберийского государства и с VII веке Аджария, по сведениям известного армянского географа А. Ширакаци, являлась отдельной административной единицей.
С созданием в начале XI века Тао-Кларджетского царства Аджария оказалась в центре феодальной Грузии. Со второй половины XII века до конца XIV века Аджария входила в состав Месхетии, являясь ее отдельным княжеством (в XIII веке Месхетия переименовывается в Самцхе-Саатабаго).
Усиление турецкой империи совпало с периодом феодальной раздробленности Грузии. Самцхе-Саатабаго был менее защищен от нападений Турции, чем остальная часть Грузии. В 1526-1547 годах турки вели постоянную войну за овладение Батумом. По турецко-иранскому договору 1555 года Грузия была поделена между ними, Самцхе-Саатабаго был разделен на две части. Большая из них отошла к Ирану. Но Турция вскоре отторгла у Ирана эти земли и к 1564 году фактически утвердила свою власть на территории до р. Чолоки, где исторически проходила административная граница Аджарии с соседней административной единицей Грузии Гурией.
Таким образом, в результате завоевания турками территории Аджарии, она была надолго оторвана от остальной части Грузии. Захваченная аджарская территория административно была разделена на Батумский и Аджарский санджаки административные округа, входившие в разные области.
Такое состояние не могло не вызвать недовольства среди населения. Поэтому период господства Турции в Аджарии отмечен множеством волнений, столкновений и сражений. Национально освободительное движение аджарского населения ставило своей целью освобождение захваченной Турцией Аджарии и восстановление Самцхе-Саатабаго. В связи с этим лидеры национально-освободительного движения в Аджарии налаживали связи с грузинскими царями, а также с на местником царя России на Кавказе.
Политика Русского государства в отношении этого региона активизировалась только после захвата Турцией всей территории Аджарии и других территорий Грузии. В 1564 году царь Иван Грозный попытался взять под свое покровительство кахетинского царя Левана, однако это событие вызвало протест как Турции, так и Ирана. Угрожая войной, Турция принудила Россию вывести войска из Терской крепости, а иранский шах Тамаз потребовал от кахетинского царя Левана удаления русского отряда из Кахети, что и было сделано.
Со стороны Грузии так же неоднократно предпринимались попытки освободить Аджарию от турецкого ига, однако все попытки терпели неудачу. Ираклий II во время переговоров с Россией уделял особое внимание вопросу возвращения захваченных Турцией грузинских земель, в том числе и Аджарии. Желание Грузии возвратить потерянную территорию совпадало с интересами России, ибо она высоко ценила торговое и военно-стратегическое положение города и порта Батуми и всей Аджарии для Российской Империи. К этому времени Россия окрепла достаточно, чтобы противостоять Турции в этом регионе и добиться возвращения Аджарии в состав Грузинского государства. Однако, как показывают исторические факты, Российскому государству пришлось три века вести борьбу с Турцией, чтобы добиться желаемых для Грузии результатов.
Освободительная борьба народа Грузии, в том числе Аджарии, увенчалась успехом благодаря победе России в русско-турецкой войне 1877-1878 годов.
Принимая во внимание финансовые затруднения Турции Россия согласилась заменить ее рядом территориальных уступок. По пункту б) XIX Сан-Стефанского договора Россия получила Ардаган, Карс, Батум, Баязит и территорию Саганлуга. Ради возвращения этих территорий Россия пошла на большие финансовые затраты.
Стремясь не потерять полностью связи с Батуми и опасаясь усиления российского присутствия на Черном море, европейские державы смогли навязать России согласие объявлением Батуми порто-франко по преимуществу коммерческим. Статус порто-франко город имел 8 лет (был упразднен в 1886 году по указу российского императора) , и принес стране определенные блага. Батуми, за короткое время стал третьим по величине городом Закавказья, а по значимости порта явился третьим в российской империи. Статус порто-франко способствовал быстрому привлечению в страну зарубежного капитала, началось промышленное развитие города, расширилась торговля. Батумский порт по количеству грузооборота вышел на третье место в российской империи после Петербургского и Одесского портов, а население города с 3 тысяч человек увеличилось до 35.000. Значение города еще более возросло после того, как с 80-х годов XIX века Батуми по географическому расположению стал самым удобным транспортным узлом для вывоза бакинской нефти. В 1883 году Батуми железной дорогой связался с Закавказской железнодорожной магистралью.
Для грузин русско-турецкая война, вне всяких сомнений, являлась освободительной. Поэтому население Грузии, включая аджарцев, активно помогло русской армии. Делу освобождения Аджарии способствовало также то обстоятельство, что аджарцы, несмотря на жестокие репрессии со стороны турок и религиозное влияние, сохранили свой родной язык, культуру, традиции и обычаи и стремились воссоединиться с Грузией. Это обстоятельство подтверждается многочисленными фактами. Так, например, русский генерал Комаров извещал главнокомандующего Закавказской армией, что расположение аджарцев к русским отменное, край ждет присоединения к России.
Воссоединение Аджарии с Россией имело эпохальное значение для Аджарии и, в целом для Грузии. Аджарцы избежали опасности национального перерождения.
Таким образом, Аджария на протяжении всей своей истории неоднократно подвергалась расчленению более сильными соседями, но всегда стремилась к единству своего народа и образованию отдельной административной единицы (княжества) в составе более крупных образований — царств, государств.
По-видимому, именно в так складывающейся истории можно найти корни сегодняшнего положения Аджарии и основам ее политики в отношении и с Грузией, и с другими государствами.